Quando um pedido é feito pelo Mercado Livre, ele aparecerá no seu painel de Vendas, como um pedido normal, porém é identificado com o logotipo na coluna de Forma de Pagamento, conforme o exemplo abaixo:

Você também consegue filtrar pelos pedidos do Mercado Livre, filtrando pelo campo “Pago em:”, como mostra a imagem a seguir: